目的:如何分析阿尔茨海默病(AD)模型小鼠前额叶皮层中差异表达的基因,从转录组水平确定AD的病因?
方法:本研究提取5只9月龄雌性APPswe/PS1ΔE9(PAP)模型小鼠和野生型C57BL/6J小鼠,提取前额叶RNA,用Illumina HiSeq 3000测序。您是否使用 EdgeR 软件来分析公式差异的重要性? AD 和对照组分析基因表达的变化并使用 qRT。六种主要差异表达基因的PCR验证?接下来,您是否对差异表达的基因进行聚类分析?
结果:AD组与对照组差异表达基因(P1.0)224个,其中上调205个,下调19个? 6个主要基因qRT? PCR 验证结果是否与NA 匹配?趋势? GO增强分析的结果是否意味着这些差异表达的基因是免疫反应?炎?它已被证明与趋化因子活性和 IgG 结合有关。 KEGG通路富集分析结果表明,这些基因参与吞噬作用、溶酶体、Toll样受体信号通路和细胞因子受体相互作用。 κB 信号。通路和其他重要的生物通路?
结论:获取AD相关差异表达基因,为模型小鼠在AD相关机制和治疗研究中的应用提供实验依据?