树鼩消化道不同部位微生物 中国实验动物信息网 2021-07-05 644

　　目的：以树鼩为研究模型，研究野生和人工培育的树鼩各肠段的菌群组成。

　　方法：采集3只健康野生和人工繁殖的树鼩，取7个胃肠道样本，提取全菌DNA，利用高通量测序技术生成16SRNA基因的V3-V4高变区，进行测序分析和比较细菌群落结构和多样性。

　　结果：对不同肠段α指数多样性的分析表明，盲肠和胃的野生组和人工繁殖组之间的香农指数存在显着差异（Pu003c0.05）。野生组与人工繁殖组肠道各部位微生物组成存在显着差异，在门水平上，野生组直肠、结肠、盲肠和胃中的Philmictes平均比例显着。高于人工繁殖组（Pu003c0.05），且人工繁殖组在直肠、结肠、盲肠、回肠中螺旋藻的平均比例显着高于野生组（Pu003c0） .05). 直肠拟杆菌平均比例显着高于人工生殖组(Pu003c0.05)。在属水平上，野生组明显高于人工养殖组。主要菌属有：回肠、空肠、胃魏氏菌、直肠拟杆菌、回肠乳球菌、人工养殖组 主要菌属明显高于野生组：回肠、结肠、盲肠、回肠短螺旋体、盲肠中的普氏菌_9、链球菌中胃、盲肠和空肠，以及回肠中的乳酸菌。对不同肠道菌群功能基因的预测表明，两组5个解剖部位、17个基因类别的差异具有统计学意义（Pu003c0.05）。

　　结论：野生树鼩和人工繁殖树鼩肠道菌群组成差异较大，各肠段的细菌功能也有较大差异，与其生理功能和饮食结构有关。在肠道菌群中，需要仔细考虑粪便样本中微生物的组成是否能够完全代表肠道菌群的组成。