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SARS-CoV-2慢性感染会引发突变

  近日,由剑桥研究人员领导的一个团队在《Nature》杂志上发表文章,报道了在接受恢复性血浆治疗的免疫受损患者的情况下,他们如何观察到SARS-CoV-2突变。特别是,他们看到在新变体中也出现了导致英国再次大规模 “封锁” 的关键突变。

  研究小组使用实验室创建的病毒变体,发现其遗传密码的特定变化,使该病毒在细胞上的感染性是普通菌株的两倍。

  病毒表面的刺突蛋白结构使其具有特征性的冠状形状,病毒利用这种蛋白质附着在宿主细胞表面的ACE2受体上,使其进入细胞,劫持其机器,使其在人体中复制和传播。当前使用或正在试用的大多数疫苗都以刺突蛋白为靶标,人们担心突变可能会影响这些疫苗的功效。

  英国剑桥领导的COVID-19基因组学英国(COG-UK)联盟中的英国研究人员已经鉴定出该病毒的一种特殊变体,其中包括可能使其更具传染性的重要变化:部分刺突蛋白中的ΔH69/ΔV70氨基酸缺失,这是该变体的关键变化之一。

  尽管已多次检测到ΔH69/ΔV70缺失,但直到现在,科学家们还没有看到它们在患者中出现。但是,在今天发表在《Nature》杂志上的一项研究中,剑桥大学的研究人员记录了这些突变如何出现在COVID-19患者中。

  相关患者是一名七十多岁的男子,他先前被诊断出患有边缘B细胞淋巴瘤,*近接受了化学疗法,这意味着他的免疫系统受到严重损害。入院后,为患者提供了多种治疗方法,包括抗病毒药物瑞德昔韦和恢复期血浆(血浆中含有从成功从系统中清除病毒的患者血液中提取的抗体)。尽管他的病情*初稳定下来,但后来却开始恶化。他被送入重症监护室接受进一步治疗,*终死亡。

  在患者住院期间,总共分离出23种病毒样本,其中大部分来自他的鼻子和喉咙,研究人员正是在这些序列中观察到了病毒的基因组突变。

  在*初的两次疗养恢复血清后的第66天至第82天之间,研究小组观察到病毒种群发生了显著变化,带有ΔH69/ΔV70缺失的变异体以及称为D796H的刺突蛋白突变成为优势。尽管这种突变*初似乎已消失,但在进行第三次瑞姆昔韦和恢复期血浆治疗后再次出现。。

  “*终获胜的病毒(具有D796H突变和ΔH69/ΔV70缺失)*初在康复血浆疗法中占据上风,然后被其他毒株取代,但在恢复治疗后又重新出现。”

  在严格控制的条件下,研究人员创建并单独测试了带有ΔH69/ΔV70缺失和D796H突变的病毒。合并的突变使病毒对恢复期血浆的中和作用不那么敏感,尽管看起来单独的D796H突变是导致血浆中抗体敏感性降低的原因。在没有血浆的情况下,仅D796H突变会导致感染丧失,这是病毒为了逃避免疫压力而获得的典型突变。

  研究人员发现,ΔH69/ΔV70缺失本身使该病毒的感染性比以前的优势变体高两倍。研究人员认为,缺失的作用是补偿由于D796H突变引起的传染性丧失。

  Gupta教授补充说:“鉴于疫苗和治疗方法均针对我们在患者体内发生突变的刺突蛋白,因此我们的研究提出了令人担忧的可能性,即病毒突变可能会战胜我们的疫苗。”

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