碱裂解法提取质粒DNA的步骤
(1)选择一个在LB固体培养基中生长的菌落,将其接种在20 ml LB(包括Amp100ug/ml)液体培养基中,并在37°C和250mp(约)下振摇过夜。 12-14小时)。
(2)取1.5 ml培养液,倒入1.5 ml Eppendorff管中,以12000pm离心1-2分钟。弃去上清液,将离心管倒置在厕纸上,以使尽可能多的液体排出。
(3)将细菌沉淀重悬于100μl溶液I中(必须剧烈振摇以均匀分散和混合细菌),并在室温下放置5-10分钟。
(4)加入200μl新制备的溶液II,合上试管口,将Eppendorff试管快速几次轻轻颠倒以混合内容物(不要摇动),并在冰中沐浴5分钟以达到细胞膜的作用。 (溶液II是一种溶解溶液),因此离心管中的细菌液逐渐变得澄清)。
(5)加入150μl预冷溶液III,紧紧盖住管口,轻轻颠倒管数次以混合,并检查是否有白色棉样沉淀物。您可以将其放在冰上5分钟。以12000pm离心10分钟。解决方案III是中和解决方案。此时,质粒DNA再生,染色体和蛋白质形成不可逆的不可溶复合物,而K +沉淀SDS-蛋白质复合物。
(6)将上清液转移到干净的Eppendorff管中,加入等量的苯酚/氯仿/异戊醇,摇匀并在12000pm下离心10分钟。 (450μl苯酚/氯仿/ iso 96 penta)
(7)小心地将上清液移至新的微量离心管中,加入两倍量的预冷无水乙醇,充分混合并在室温下放置。在12000pm x 10分钟下离心2-5分钟。
(8)弃去上清液,打开试管并放在卫生纸上,以排出所有液体,加入1 ml 70%的乙醇洗涤沉淀并在12000pm下离心5分钟。 ..
(9)吸去上清液,将试管倒置并放在厕纸上,沥干液体,使其在室温下干燥。
(10)将沉淀物溶于20μlTE缓冲液(pH 8.0,含20μg/ mlnaseA,约4μl)中,并在37°C的水中浸泡30分钟,以在-20°C下降解RNA分子。存放在冰箱中。
2.10.2实验试剂和制剂:
(1)LB液体介质
称取10 g胰蛋白,、 5 g酵母提取物(酵母提取物),10 gaCl,溶于800 ml蒸馏水中,并用NaOH调节pH值。调整7.5、加水直至总体积为1升,并在高压下蒸汽灭菌15分钟。
(2)氨苄西林(Ampicillin,Amp)母液:制成100 mg/ml水溶液,并储存在-20°C以便以后使用。 (3)溶液I 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH8.0),10mM EDTA(pH8.0)。制备方法:将ddH 2 O加入到12.5ml 1MTris-HCl(pH8.0),10ml 0.5MEDTA(pH8.0),4.730g葡萄糖和500ml中。在121°C高压灭菌15分钟,然后在4°C储存。
(4)溶液II 0.2MNaOH,1%SDS
制备方法:将2MNaOH1ml,10%SDS1ml,ddH2O加入10ml。使用前的临时设置。 (5)溶液III:钾乙酸钾(KAc)缓冲液,pH 4.8
制备方法:将ddH2O加入300 ml 5MKAc,57.5 ml冰醋酸和500 ml中。存放在4°C以便以后使用。
(6)苯酚/氯泡沫/异戊醇(25:24:1)
氯泡沫有助于使蛋白质变性并使液相与有机相分离。异戊醇可以消除泡沫提取过程的发生。苯酚和氯仿均具有高度腐蚀性,在操作过程中需要戴手套。
(7)无水乙醇
(8)70%乙醇
(9)TE:10mMTris-HCl(pH8.0),1mM MEDTA(pH8.0)。制备方法:将ddH2O加入1ml 1M Tris-HCl(pH8.0),0.2ml 0.5MEDTA(pH8.0),100ml中。在121°C下高压灭菌20分钟,并在4°C下保存以备后用。
1MTris-HCl(Tris(三羟甲基)氨基甲烷)制备:将121 g Tris碱溶解在800 ml H2O中,用浓盐酸调节pH值,充分混合并加水至1L。
0.5MEDTA(乙二胺四乙酸):将186.1gNa2EDTA.2H2O溶于700mlH2O,用10MNaOH将pH调节至8.0(需要约50ml),然后将H2O加至1L。
(10)RNase A母液:将RNase A溶解在10 mmol/LTris?Cl(pH 7.5),15 mmol/LaCl中制成10 mg/ml溶液,并在100°C加热15分钟。冷却后,使用1.5 ml的Eppendorff管将其破碎成小块,并保存在-20°C下。