肠道菌群,动物造模 中国实验动物信息网 2020-09-25 1343

　　目的    探究导盲犬和淘汰犬之间肠道菌群的差异，分析两者特征性差异菌群。

　　方法    收集16只导盲犬和10 只淘汰犬的新鲜粪便样本，按照犬品种和性别分为拉布拉多雄性导盲犬（GD-ML）和淘汰犬（ED-ML）、拉布拉多雌性导盲犬（GD-FL）和淘汰犬（ED-FL）、金毛雄性导盲犬（GD-MG）和淘汰犬（ED-MG），另外从中随机抽取9只导盲犬和4只淘汰犬分为导盲犬组（GD）和淘汰犬组（ED），共分为4组配对。提取粪便样本总DNA，应用PCR-DGGE技术获得肠道菌群图谱，应用相关软件和统计学方法对每组配对进行差异性分析。

　　结果    聚类分析结果显示，GD和ED，GD-ML和ED-ML，GD-FL、ED-FL和GD-MG均各归为一类，表明导盲犬和淘汰犬之间肠道菌群存在差异。肠道菌群多样性、丰富度和均匀度分析结果显示，每两个配对组之间多样性指数、丰富度指数和均匀度指数存在差异，但差异均无统计学意义。差异性条带测序分析结果显示∶与ED相比，CD Megamonas funiformis YIT 11815菌株增多;与ED-ML相比，GD-ML Succinatimonas hippei YIT 12066、Lactobacillus vaginalis DSM 5837、Lactobacillus acidophilus NCFM、Faecalibacterium prausnitzii A2-165菌株增多，Collinsella aerofaciens ATCC 25986和Prevotella copri DSM 18205菌株减少;与ED-FL.相比，GD-FL Ruminococcus gnavus AGR2154、Fusobacterium russii ATCC 25533菌株减少;与ED-MG相比，GD-MG Tropheryma whipplei str.Twist菌株增多。

　　结论    本研究发现导盲犬和淘汰犬肠道菌群存在差异，未来对差异菌群的进一步研究可能有助于辅助导盲犬的早期筛选。