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染色质基因分析可识别癌症起源

  美国杰克逊研究所(JAX)的研究人员开发了一种新方法,可以通过对开放染色质进行全基因组分析来确定引起特定类型白血病的细胞类型,该方法在白血病的诊断和治疗中起着重要的作用。

  所有癌症都始于单个细胞突变。了解癌细胞的起源细胞可以使研究人员分析癌症亚型并开发新的诊断和治疗方法,但是现有方法可以从大量肿瘤细胞样本中提取起源细胞。很难识别。染色质是细胞核的重要组成部分,由DNA,组蛋白和RNA组成。在细胞分裂的某些阶段,它会浓缩并收缩成染色体。每种细胞类型都有自己的染色质结构。封闭的染色质紧密包裹在核小体周围,相对没有活性。开放的染色质和核小体之间的连接相对较松散,活性更高。杰克逊研究所(Jackson Institute)的助理教授詹妮弗·特罗布里奇(Jennifer Trowbridge)博士通过分析肿瘤细胞的开放染色质,改进了目前鉴定肿瘤细胞起源的方法。

  Tokutan BRICH带领他的同事在实验室中建立了急性髓细胞白血病(AML)的小鼠模型。他们从人和小鼠骨髓中鉴定出五种类型的细胞:长期造血干细胞,短期造血干细胞,多能前体细胞,常见的骨髓前体细胞和粒细胞巨噬细胞前体细胞。由这些不同来源的细胞引起的AML对小鼠表现出不同的侵袭性。干细胞引起的损害更具侵袭性,而祖细胞引起的损害则侵袭性小得多。不同侵袭性诱导的白血病细胞发生频率也不同。干细胞高而祖细胞低。研究人员分析了各种AML细胞样品中的开放染色质,并将它们与正常细胞中的开放染色质模式进行比较,以确定干细胞在AML细胞样品中的开放染色质特性和基因表达模式。区分由AML引起的AML和由前驱细胞引起的AML。

  研究人员说,对健康人和AML患者人群中干和祖细胞开放染色质的进一步研究可以基于细胞起源,癌症确定更准确的癌症生物标志物对于诊断和治疗很有用。

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