动物造模 中国实验动物信息网 2024-04-19 2316

　　目的：对五指山小型猪PPARγ2基因启动子调控区域多态性进行分析｡

　　方法：根据猪PPARγ2启动子调控区域2200bp设计5对引物,对57头封闭群五指山小型猪的多态性进行检测,并用多种生物信息学软件对调控区域的启动子､转录因子结合位点､RNA二级结构､CpG岛进行预测分析｡

　　结果：筛选到9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点,分别是:-1595T/C､-1534G/A､-1262C/A､-1220C/A､-1017A/G､-963A/G､-955G/A､-866A/G､-333G/A｡SNPs都没有处在软件识别的启动子区域中,但-333G/A突变位于核心启动子(-656~-23bp)区域｡突变的SNP位点附近转录因子结合位点会发生改变,突变前后RNA二级结构*小自由能发生变化,其结构也发生显著变化｡目标序列未找到CpG岛｡

　　结论：筛选到的五指山小型猪PPARγ2启动子调控区域SNPs可能对该基因的表达调控产生影响,为进一步研究其功能奠定基础｡