动物造模 中国实验动物信息网 2023-05-08 1115

　　目的    以树鼩为研究模型，探讨野生树鼩与人工繁育树鼩不同肠段的菌群组成。

　　方法    分别收集 3 只健康野生及人工繁育树鼩七个胃肠段样本，提取细菌总 DNA，采用高通量测序技术对 16S rRNA基因的 V3-V4 高变区测序，分析比较菌群结构及多样性。

　　结果    不同肠段 Alpha指数多样性分析显示野生组与人工繁育组树鼩在盲肠和胃 Shannon 指数存在显著差异(P<0.05)。野生组与人工繁育组各肠段微生物组成存在较大差异，门水平上，野生组直肠、结肠、盲肠及胃四个部位中Firmicutes 菌门的平均占比显著高于人工繁育组(P<0.05)，人工繁育 组直肠、结肠、盲肠及回肠内 Spirochaetes 菌门的平均占比显著高于野生组(P<0.05)，野生组直肠Bacteroidetes 菌门的平均占比显著高于人工繁育组(P<0.05)，属水平上，野生组明显高于人工繁育组的主要菌属为:回肠、空肠 和胃内的 Weissella菌属，直肠内的 Bacteroides 菌属以及回肠段内的Lactococcus 菌属，人工繁育组明显高于野生组的主要菌属为:直肠、结肠、盲肠及回肠内的 Brachyspira属，盲肠和胃内的 Prevotella_9 菌属，盲肠和空肠内的 Streptococcus属以及回肠中的 Lactobacillus 菌属。不同肠段菌群功能基因预测显示两组共有 5个解剖部位17 个基因类别之间的差异有统计学意义(P<0.05)。

　　结论    野生树鼩与人工繁育树鼩各肠段菌群组成差异较大，各肠段细菌功能差异较大，且与其生理功能、饮食结构有一定关联，在肠道菌群研究中，应充分考虑粪便样品微生物的组 成是否能够完全代表肠道微生物的组成。