目的:研究野生实验室饲养和生活条件下东方田鼠肠道菌群的分布和差异?
方法:你对肠道菌群16 SDNA使用高通量测序技术吗? V4?您想确定 V5 并分析实验室和野外序列中捕获的东方田鼠、统计分类群 (OTU) 和细菌物种的丰度吗?和分发有区别吗?
结果:对于稀疏曲线,样本量是否合理,排序是否充分?在门水平上,实验室培养的肠道菌群和野生肠道菌群的分布和比例基本相同。实验组有1个地方性细菌Lentisphaerae,野生组有3个地方性门Fusobacterium?有。对于未归类为 Taumarkeotaphyllum 的门,Tenericutes 门的丰度差异是否*大?在属水平上,田鼠肠道细菌比实验室培养的细菌更丰富。*大的区别是管腔瘤胃球菌的丰度?
结论:获得了实验室和野生条件下东方田鼠肠道菌群结构的差异,进一步丰富了东方田鼠的基础生物学数据。