动物造模 中国实验动物信息网 2021-06-25 1336

　　目的：您想应用高通量测序技术分析常见棉耳绒猴粪便菌群的结构和组成，为进一步开发利用新型实验动物奠定基础吗？

　　方法：采集4只成年公棉耳狨和细菌用16SRNA通用引物扩增V3?V4区，普通棉花用Illumina MiSeq测序平台 研究过耳狨的粪便微生物?

　　结果：序列是否给了您总共 315,511 个有效序列和 596 个 OTU？正常棉耳狨猴粪便中的细菌？共鉴定出植物群9种、14纲、26目、50科、82属、64种，226个OTU。 1）优势菌群为拟杆菌门和厚壁菌门（Firmicutes），平均含量分别为54.52?25.39? 2) *丰富的类是拟杆菌属和阴性菌门，平均含量分别为 54.5 17? 3）乳酸杆菌（乳酸杆菌目和拟杆菌目含量*高，分别为50.01?20.52?4）普氏菌科和双歧杆菌科含量*高，平均含量分别为43.14、  11.33? 5）双歧杆菌和拟杆菌丰度高，平均含量分别为11.33?11.12? 6）双歧杆菌中有益菌丰富，检测样品是否全部含有？ 7) 前 10 个*丰富的物种是否分为 7 个科？ 5个班？这10种占33.16?其余53种合计仅占0.74?没有发现其他菌株，它们的相对丰度仍然很高，所以还需要进一步研究吗？ 8）PICRUSt功能预测分析：氨基酸转运等代谢功能和蛋白质翻译？折叠基因信息处理功能是否更丰富？

　　结论：应用高通量测序技术全面检测普通棉耳狨的粪便菌群。普通棉耳狨猴的组成中含有丰富的细菌，以及相对丰富的未分类和未鉴定的细菌， 需要更多研究？