动物造模 中国实验动物信息网 2021-06-25 1043

　　目的：您想对整个西藏小型猪基因组中的组蛋白修饰位点进行注释，并比较不同组织间组蛋白修饰的差异吗？

　　方法：收集两只3个月大的雄性非胎藏迷你猪。收集血液和肝脏。 , 小肠（回肠）和背*长肌组织样本，进行染色质免疫沉淀实验，捕获 DNA 片段进行高通量测序？机器外数据被过滤并与参考基因组进行比较。使用 MACS 软件计算读取的丰富度。在基因组上？

　　结果：不同的组蛋白对基因启动子区域的分布有不同的优先位置，分布规律大致可以分为两类。在一种类型中，例如 H3K4me3、组蛋白修饰主要是双边分布的。在转录起始位点，下游 TSS 附近有一个狭窄、清晰的峰。其他类型的组蛋白修饰，如 H3K9me3、更均匀地分布在整个启动子区域，呈现出整体外观。内侧和高边的低峰；受组织特异性组蛋白修饰影响的基因不同，对应的功能通路也比较广泛，但它们是否都参与了RNA聚合酶II启动子的转录调控？

　　结论：这项研究对西藏小型猪四种组织的组蛋白修饰注释数据是否为未来使用西藏小型猪作为生物医学模型的转录调控研究提供了基础数据？