*近,中国科学院海洋科学研究所的海洋动物再生和基因工程项目组已使用高通量测序技术来搜索和分析凡纳滨对虾的基因组,南美对虾是世界上虾遗传学的*佳标记。我们已经成功地建立了密度。相关研究结果*近发表在《科学报告》上。博士后研究员于洋和研究员张晓军是本文的共同主要作者。基因组探索分析的结果表明,凡纳滨对虾基因组中重复序列和杂合子的比例非常高,并且由于其复杂性高,世界范围内的长期全基因组测序和组装已经开始。表示工作被延迟。据信这是目前的情况。*难完成或排序的物种之一。基于基因组探索,研究团队建立了一个高通量序列库,并对所有人工育成的兄弟姐妹的父母和205个后代进行了简化的基因组测序。
*终的图谱包含与南美白对虾两半中的染色体数目匹配的44个连锁群。集成图包含6,146个标记,总图距为4,271.43cM,标记之间的平均图距为0.7cM。同时,该团队使用该图成功找到了11个与长度相关的QTL和7个与体重相关的QTL。这为促进分子标记辅助育种研究和南美白对虾整个基因组的选择性育种提供了重要资源。
南美白对虾是中国和世界上*大的虾,也是世界上产量*高的单一虾类。培育新的高产抗逆虾种对虾养殖业的发展至关重要。密集的基因连锁图谱可识别关键经济特征的QTL位点,并使用由此产生的与生长相关的分子标记来支持经典育种,从而可以显着加速新虾品种的育种过程。
目前,研究团队正在采取多种策略来确定和组装凡纳滨对虾的整个基因组序列。使用由基因组统计局收集的基因组序列数据和BAC末端测序数据,完成了基因图谱,基因组组装支架和BAC克隆的初始整合,然后是整个基因组序列组装和关键基因定位。奠定了坚实的基础。