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【动物造模】-猪圆环病毒2型感染人源细胞的转录组分析

  目的:猪圆环病毒2型(PCV2)感染人类细胞的可能性一直存在争议。这项研究使用转录组测序(RNAsequencing,RNA-seq)技术来分析人源细胞感染后PCV2的差异表达基因,相关信号通路和生物学功能。该研究提供了参考。

  方法:用PCV2感染HeLa细胞,并进行RNA序列分析以筛选具有抗病毒反应相关表达差异的基因(DEG),并通过实时定量PCR进一步验证。

  结果:在感染PCV2的HeLa细胞中,总共注释了15402个UniGene,包括387个DEG,其中包含267个上调基因和120个下调基因。 GO富集和生物过程DEG的KEGG通路分析发现,富集的基因参与了应激反应(97/291DEG)和免疫系统过程(80/291DEG),这是*重要的两个途径基因是NOD样受体。与体细胞信号传导途径(21/170DEGs)和单纯疱疹病毒感染途径(22/170DEGs)相关的基因的差异表达。

  结论:当PCV2感染HeLa细胞时,细胞的表达谱发生变化。 DEG和获得的功能注释信息对于理解其抗病毒机制,以及理解感染PCV2的人类细胞的免疫应答和抗病毒作用非常有用。

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