2型糖尿病 中国实验动物信息网 2020-09-23 467

　　GoT2D和T2D-GENES项目的研究人员分析了2型糖尿病（T2D）的遗传特征，发现大多数T2D突变位点都围绕先前GWAS研究中确定的常见突变。做到了很少有罕见的基因突变构成T2D的相对风险小。

　　大多数T2D变异更为普遍

　　研究人员对近2700名欧洲血统的人进行了全基因组测序，并比较了有无T2D个体的遗传模式。他们还分析了超过12,900例T2D病例和五个不同祖先群体的对照的基因组蛋白编码区，并使用基因分型法分析了约111,550人的基因组突变。这项研究特别关注了潜在的功能等位基因，分析了常见和罕见的变异，并鉴定了在特定人群中引起T2D风险的几个基因座。结果表明，大多数T2D变异位点都围绕先前GWAS研究中确定的常见变异。

　　文章的共同主要作者，布罗德研究所和马萨诸塞州总医院医学和人口遗传学研究员Jason Flanic说： “ 2型糖尿病的遗传风险有成百上千种。基于这项大型研究的结果，像Jason Flannick这样的研究人员说，”了解T2D的遗传基础是很普遍的。需要确定突变（主要是非遗传突变）。编码）已在影响疾病风险的机制中投入了更多的精力。”

　　罕见的遗传变异风险较小为了深入了解 T2D的遗传结构并研究稀有变异的潜在功能，研究人员使用了低覆盖基因组测序数据，深外显子组测序数据和芯片分型数据。分析了1,326位患有T2D的个体和1,331位没有T2D的个体。所有研究对象均来自通过GoT2D联盟获得的北欧和中欧地区。研究人员已经在这些个体中检测到2670万个SNP，小的indel或大的缺失。结果是在四个与T2D相关的基因座上发生了126个突变。通过分析GoT2D样品并在欧洲对另外11,645例病例和32,769例对照进行了基因分型，研究小组将变异信息扩展到14个位点的674个可疑变异。其中包括一个新发现的基因座，结果通过对115,000个病例和对照进行的重复实验得到了证实。研究人员在分析中检查了已知的T2D基因座，发现了另外两个与T2D相关的罕见突变。

　　研究人员分析了28,305例欧洲病例和51,549例对照的数据。使用使用T2D-GENES数据设计的Illumina的Exxon芯片对它们进行基因分型。研究人员已经在12个已知基因座和1个新基因座上发现了T2D的全基因组关联。

　　亚洲人群中的特殊基因突变

　　接下来，我们分析了GoT2D的单个数据以及6,504个T2D病例和6,436个对照的外显子组测序数据。这些主题来自欧洲，南亚，东亚，西班牙裔，非裔美国人的T2D-GENES项目。研究人员已经发现了超过300万个蛋白质编码序列变体中与T2D高度相关的全基因组变体。该基因变异存在于PAX4转录因子中，并与东亚人群患T2D的风险有关。通过分析T2DGWAS基因座附近的基因，研究人员发现FES基因附近的位点与南亚人群的T2D风险显着相关。通过分析受这些突变影响的基因，研究人员建立了T2D遗传结构的模型，并开始分析影响T2D风险的功能性等位基因的信号。