生殖细胞变异,癌症基因 中国实验动物信息网 2020-09-21 488

　　目前，为了降低成本并节省时间，大多数癌症基因检测仅分析癌症组织，而不分析生殖细胞DNA。可能会导致误诊或误判。本文提供了有关此问题的一系列分析和讨论。根据国家人类基因组研究所（NHGRI）和国家癌症研究所（NCI）的说法，通过分析癌症组织获得的突变可能包括生殖细胞突变，这些突变是癌性的。

　　临床测序探索性研究联盟（CSER）肿瘤学工作组由NHGRI和NCI资助。研究人员主要来自密歇根大学，哈佛大学，俄亥俄州立大学，宾夕法尼亚大学，得克萨斯州小儿癌症中心，贝勒医学院，他们为实验室中的癌症测序测试制定了一套指南。我们已经在美国国家癌症研究所（National Cancer Institute）发表了一些建议。

　　根据CSER工作组的说法，如果在实验过程中未特别搜索生殖细胞突变，那么研究所将这样做，因为如果识别出这些突变，将影响患者及其家人的管理。您需要注意各种变异。

　　本月早些时候，纪念斯隆·凯特琳癌症中心的研究人员报告说，使用包含341个基因的检测组对肿瘤DNA进行分析后发现，有16％的患者患有致病性生殖细胞突变。 ..此外，在有癌症风险的患者中检测到的许多突变实际上是生殖细胞突变。这些生殖细胞变异还影响患者的治疗以及其家庭中癌症风险的预测。  4月，约翰·霍普金斯大学的研究人员发现，如果不将它们与正常样本进行比较分析，则在3％的患者中鉴定出的肿瘤突变实际上就是胚胎细胞突变。

　　如何解决问题？研究人员在

　　CSER工作组的一篇文章中说： “他们提供了这种情况和实验室应该考虑的相应问题。

　　首先，癌症专家组通常被认为是BRCA1、BRCA2、林奇综合征突变体等。该基因中包含癌症突变基因

　　接下来，一些突变模式表明生殖细胞中可能存在突变，例如，超突变肿瘤中DNA错配修复基因的突变。通常表示生殖细胞发生突变，而儿童骨髓瘤中较大的染色体重排也意味着生殖细胞中TP53基因发生突变，此外，生殖细胞和体细胞中也观察到许多基因突变。然而，这类基因通常是癌症易感基因，例如MSH2、ALK，RB1、TP53、VHL。

　　生殖细胞突变，临床关注应转向

　　研究人员说“由于需要将突变分析和临床解释相结合，我们认为医生和实验室应该共同努力解决生殖细胞突变的问题。”

　　工作组进行癌症患者癌症小组，外显子组或全基因组序列分析的实验室建议建立一个生物信息学平台，以鉴定生殖细胞突变。另外，实验室需要制定适当的策略来识别潜在的生殖细胞突变。在制定此策略时，您需要考虑如何从患者那里获得生殖细胞样本，实验室将自己执行测试还是与诊断机构合作。简而言之，实验室应该开发一种用于鉴定生殖细胞变异的标准化方法。

　　此外，医生还负责告知患者该基因检测可能发现基因突变，并且可能影响治疗和家庭癌症风险评估。医生还需要计划如何将生殖细胞突变的结果传达给患者。简而言之，基因检测可能会受到生殖细胞突变的影响，因此医生和实验室需要找到有效的解决方案以减少对患者的误诊。