动物实验,Fkbp51基因敲除 中国实验动物信息网 2020-09-02 632

　　目的：研究Fkbp51基因敲除（KO）和野生型（WT）小鼠肝脏表达谱对肝脏组织中基因选择性剪接的影响。

　　方法：使用下一代测序对Fkbp51 KO和WT小鼠的肝表达谱进行测序，使用TopHat，KO和WT小鼠对RNA测序结果进行替代剪接分析筛选内含子在肝组织中的差异保留。 ，RI）和外显子跳跃（SE）。使用在线工具DAVID对这些不同的替代剪接体进行遗传（GO）和代谢途径（kyotoencyclopediaofgenesandgenomes，KEGG）富集分析，同时使用NCBI基因数据库注释这些基因去做。

　　结果：（1）Fkbp51的缺失可能引起小鼠肝脏mRNA选择性剪接的变化；

　　（2）Fkbp51基因敲除可能导致小鼠肝mRNA选择性剪接的表达变化；

　　（3）GO和KEGG分析通过研究，我们发现这些经过特殊改变的剪接的基因主要与脂肪相关衍生物的代谢，免疫力和胆汁酸分泌有关。

　　（4）与差异内含子保留相关的基因主要与肌动蛋白细胞骨架的调节以及氨基酸及其衍生物的代谢有关。

　　结论：Fkbp51基因敲除可能改变基因组中mRNA的可变剪接，从而影响小鼠肝脏的代谢功能。