图 新冠病毒特异性TCR筛选鉴定流程
在国家自然科学基金项目(批准号:92374105)等资助下,厦门大学医学院王科嘉教授课题组在新型冠状病毒特异性 T 细胞受体鉴定方面取得进展。研究成果以“鉴定新型冠状病毒特异性 T 细胞及其受体(Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor)”为题,于2024年3月27日在《血液学与肿瘤学杂志》 (Journal of Hematology & Oncology)杂志上发表,论文链接:https://doi.org/10.1186/s13045-024-01537-6。
针对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)疫苗诱导中和抗体免疫不足及 SARS-CoV-2 特异性 T细胞受体(TCR)的精确识别机制尚不明确的问题,研究团队基于免疫组库分析,开发机器学习模型用于预测新冠病毒TCR组库;从人外周血中,利用特异性抗原肽刺激、免疫组库测序(IR-seq)及基于深度学习的预测TCR识别免疫原性多肽框架(DLpTCR)等方法,筛选出能够识别新冠病毒抗原的TCR序列,并制备TCR-T工程细胞;利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)、IR-seq和流式细胞术等方法评估疫苗诱导的细胞免疫应答,发现新冠鼻喷疫苗可有效激发免疫反应。本研究揭示了新冠感染后特异性T细胞的演进与功能,阐明了TCR对新冠病毒抗原表位的靶向识别机制,通过TCR-T的方式拓展了T细胞的精准识别在病毒感染中的应用。