中国科学院北京基因组研究所的研究人员对小鼠基因表达在怀孕,哺乳和小鼠乳腺发育退化期间的转录组学研究进行了研究。查找在乳房发育中起重要调节作用的蛋白质编码基因,转录因子和miRNA。乳腺是哺乳动物中独特的器官,分娩后90%的发育过程被集中。在生殖过程中,乳腺发育经历三个阶段:怀孕,哺乳和变性(称为怀孕-泌乳周期)。
为了更好地了解乳腺发育达到转录组水平的机制,研究人员使用核糖体RNA消耗研究了三个阶段(妊娠12天,泌乳14天和变性7天)。构建了小鼠乳腺的总RNA文库,每个文库生成的数据量超过5 x 107个读数。由于在怀孕和哺乳期间乳房的形态和功能发生了显着变化,因此在发育的不同阶段对乳房基因表达的研究可以阐明这些差异的原因。
除了一系列相关的生物学信息外,RNA-seq基因表达数据还鉴定了几种蛋白质编码基因,转录因子和miRNA,它们在乳腺发育中起主要调控作用。泌乳过程中大多数下调的基因都参与其中。